До початку 90-х років 20 століття в Клайпеді діяв тільки один православний храм, збудований ще в 1947 році. Задумка про спорудження нового храму існувала вже тоді, але реальних можливостей для здійснення вона не мала.

Початок 90-х років можна охарактеризувати потужним потоком великої кількості людей Божі храми; чимала кількість людей приймали хрещення. З цих причин Клайпедський храм ледве вміщав усіх бажаючих прослухати недільну літургію. Одними з постійних парафіян церкви стала сім'я Артамонових: чоловік Володимир був директором школи, а дружина - вчителькою малювання в школі.

Коли в школі звільнилося кілька приміщень, Володимир Артамонов запропонував духовенству розташувати тут Дім молитви. Прибудова мала місце для притвору, а також місце для занять в недільній школі, а міська влада дала згоду на благоустрій Будинку молитви.

Для реконструкції старих приміщень знадобилося чимало зусиль: потрібно було обладнати окремий вхід в храм, змінити форму вікон і відокремити приміщення для молитов і навчання один від одного. Вже в процесі будівництва нового Будинку молитви люди стали приходити до школи і допомагати з будівельними роботами, крім того, під час побудови храму стали відбуватися і перші служби, які проходили в незручних умовах, але віруючих це не зупиняло.

Стіни храму були розписані художником Валерієм Осышным, які проживали у той час у Клайпеді. Це був дуже працьовита людина, адже всього за рік він розписав всі стіни храму, які відрізнялися художньою свободою і чистотою ліній. Після оформлення стін владика Хризостома став готувати приміщення до висвітлення: було встановлено вівтарний піднесення та іконостас.

Храм в ім'я Святих мучениць Віри, Надії, Любові та їх матері Софії в 1995 році був висвітлений Клайпедським архімандритом Антонієм. Назва церкви обрали не випадково, адже саме діви, що постраждали за віру в Христа, вважаються покровительницами церковного служіння дітям.

У внутрішньому облаштуванні школи брали участь і вчителі. Християнський напрямок школи не могло не вплинути на навчальний процес і в багатьох школах і середніх навчальних закладах Клайпеди, де почали викладати основи релігії. Через деякий час школа була названа на честь святого Андрія Рубльова, який був іконописцем 15 століття. Саме ця подія тісно зв'язало школу з православ'ям.

Важливою подією, що сталася у школі імені Андрія Рубльова, стало зведення в чин ієрея Володимира Артамонова Литовським і Віленським митрополитом Хризостомом, при цьому Артамонов так і залишився директором школи. Це було єдиним прецедентом у Віленській православної церкви, коли секулярні обов'язки виконувала духовна особа. В школі з'явилася іконопис, очолювана самим директором, а троє учнів школи надійшли в МПСТБИ – іконописне відділення.

У новому приході знайшлися люди, які серйозно зайнялися виданням літератури суспільно-релігійного спрямування. Парафіяльний Вісник» випустив перший номер вже в 1996 році, в якому були висвітлені питання церковного життя. А в 1999 році прихід випустив книгу «Не залишу вас сиротами», написаної по ідеям протоієрея Понтія Рупышева, який служив в Литовській і Віленської єпархії.

При церкві стала працювати недільна школа, в якій викладалися ази богослужіння в храмах і Православ'я. Зараз в школі проходять подібного роду заняття для груп людей, що мають різні рівні підготовки. На заняттях викладаються: історія церкви, Закон Божий, театральне майстерність і церковний спів. Молоді люди роблять постановки, які показують батькам, беруть участь у богословських конкурсах по святах.

Навесні 2004 року Володимир Артамонов проводив конкурс малюнка серед дітей «Слов'янський джерело», присвячений апостолам Кирилу і Мефодію. На цей конкурс надійшла величезна кількість робіт, і тепер форум проводять щорічно.

Завдяки о. Володимиру Артамонову у Литві став відомий і затребуваний пензенський архітектор Дмитро Борунов, адже за його проектами побудовано чимало російських православних храмів.