Стародавнє місто Бакота розташований на лівому березі річки Дністер. У XIII столітті місто Бакота був у Понизьи ("область" в Галицько-Волинському князівстві) адміністративним центром, займав площу приблизно в десять гектарів, а населення становило близько 2, 5 тис. осіб. Перша літописна запис про це місто датується 1240 роком.

Під час археологічних розкопок на території стародавнього міста були виявлені сліди давніх поселень доби пізнього палеоліту, а також неоліту. Тоді ж були досліджені залишки слов'янського поселення черняхівської культури, що існувала в II-VI ст. до н. е., поселення часів київської Русі, а також рештки городища і православного скельного монастиря періоду XII-XIII століть.

В 1431 році, коли Литва і Польща уклали перемир'я, місто стає прикордонним. Наслідком цього стало повстання населення, в ході якої поміщики були вбиті, а територія міста проголошена незалежною. Через три роки бунт був жорстоко придушене польськими військами. Винуватців бунту покарали, вдома їх спалили, замок зруйнували, а населення розігнали. Таким чином, Бакота як міста перестала існувати.

У наступні століття Бакота існувала як невелике поселення зі спокійним засадою життя. Навіть такі масштабні події, як голод 1933 року і бойові дії Другої світової війни, її не торкнулися. Хоча з приходом радянської влади територія знову стала прикордонної (по річці Дністер проходив кордон з Румунією). Своє існування Бакота закінчила в 1981 році, коли для будівництва Новодністровської ГЕС було прийнято рішення підняти рівень води в Дністрі, наслідком чого стало затоплення прибережних сіл.

Сьогодні Бакотою називають частину берега Дністра, на якому збереглися лише залишки скельного чоловічого монастиря.