Коптський музей є центром, де зібрані твори мистецтва і пам'ятники культури коптів, яких знають як прямих нащадків стародавніх єгиптян. Копти заселяли територію стародавнього Вавилона, де в подальшому був заснований Каїр. У культурі коптів помітно дивовижне переплетіння традицій Єгипту і Греції і християнства. В наші дні копти становлять десять відсотків населення Єгипту.

Коптський музей був заснований та відкритий в 1910 році колекціонером і чиновником Маркусом Симайком. Основою експозиції музею стала його особиста колекція, а в подальшому вона поповнилася реліквіями і артефактами, які передавали церкви і монастирі з усієї країни. На даний момент кількість одиниць музею становить близько 16 тисяч і розміщуються вони в двадцяти дев'яти залах. Тут представлені ікони, фрески, церковне начиння, архітектурні деталі, гобелени, стародавні манускрипти. Тут можна побачити дивовижні зразки ткацтва і вишивки золотою. В музеї знаходиться стародавня бібліотека, що складається з папірусних рукописів.

Архітектура будівлі музею нагадує мечеть, пов'язуючи коптську культуру з єгипетської. На цій зв'язку акцентують увагу і деталі в інтер'єрі музею, які є загальними для християнства і мусульманства. Це різнокольорові вітражі, розписи на стінах. Подвір'я музею прикрашений невеликими фонтанами з кольоровими каменями.

У 2006 році була проведена масштабна реконструкція музею, яка також передбачала значне поповнення колекції. Стара частина музею складається з двох розділів, нова частина налічує вісім розділів.