Музей Мистецтв і Науки Університету Святого Томаса – це найстаріший діючий музей на Філіппінах. Він був заснований в 17 столітті як сховище мінералогічної, ботанічної та біологічної колекцій університету. Згідно зі старовинним іспанським законом про освіту, колекції використовувалися як навчальні матеріали в рамках викладання курсів по медицині і фармацевтиці.

У 1871 році Рамон Мартінез, член ордену домініканців і професор природної історії, заснував університетський Музей Мистецтв і Науки – він і вважається творцем. Однак справедливості заради варто відзначити, що систематично поповнювати колекції почав ще в 1682 році чернець-домініканець Касто де Элера, він же був першим укладачем музейного каталогу.

Сьогодні цей найстаріший філіппінський музей є сховищем наукових і художніх цінностей, у тому числі творів мистецтва. Починаючи з 1941 року адміністрація музею набуває роботи філіппінських художників, таких як Фернандо і Пабло Аморсоло, Карлос Франсіско, Вісенте Манансала і Гало Окампо, - колекції живопису зібрані роботи майстрів 17-20 століть. Ряд постійних експозицій музею присвячений природної історії, етнографії, релігійного мистецтва філіппінців, предметів східного мистецтва. Тут же зібрані значні колекції монет, медалей та пам'ятних речей.

У будівлі музею працюють також галерея, сувенірний магазин, невелика бібліотека та лабораторія. Регулярно тут проходять різні художні виставки.