Катакомби Сан Джованні – стародавні катакомби в Сіракузах, датовані 4-6 ст. н. е. В кінці 19 – початку 20 століття їх ретельно вивчив археолог Паоло Орсі, один з видних дослідників доісторичного спадщини Італії. Сьогодні це єдині катакомби в Сіракузах, відкриті для публіки, що робить їх і однією з найбільш популярних туристичних визначних пам'яток.

З усіх існуючих у Сіракузах катакомб саме катакомби Сан Джованні є найбільш пізніми – вони служили кладовищем для місцевої християнської громади в 4-6 століттях н. е.., коли гоніння послідовників Ісуса вже припинилися. Можливо, саме тому вони мають чіткий план і мистецьки оздоблені – їх творцям не було потреби ховатися. Досі не встановлено, чи був тут похований якийсь святий. А крипта з прахом першого єпископа Сіракуз Маркіяна, нині входить у музейний комплекс «Катакомби Сан Джованні», спочатку розташовувалася окремо від кладовища і тільки нещодавно увійшла до його складу. У цій крипті можна побачити кілька фресок із зображенням Мадонни з Немовлям і різних святих, виконаних в часи візантійської епохи і аж до 17 століття.

Назва катакомб походить від назви церкви Іоанна Богослова (Сан Джованні по-італійськи), побудованої в норманську епоху над криптою святого Маркіяна. Церква спочатку була виконана в романському стилі, потім були додані готичні елементи, але під час землетрусу 1693 року вона була зруйнована.

Незважаючи на те, що катакомби були закинуті з 6 століття, про них було відомо. В кінці 19 століття археолог Саверио Каваллари виявив тут відмінно зберігся саркофаг 5 століття, який назвали саркофагом Адельфии. Саме після цього почалося детальне вивчення ранньохристиянського кладовища, яке, як вже говорилося вище, здійснив Паоло Орсі. У роки Другої Світової війни під час авіанальотів у підземеллях катакомб ховалися жителі Сіракуз. Сьогодні і руїни церкви Сан Джованні, і крипта Сан Марчіано, і катакомби входять до складу єдиного музейного комплексу і відкриті для туристів.

Оскільки катакомби були створені на місці античного акведука, вони мають чіткий план – широку центральну галерею з кількома другорядними тунелями і круглими приміщеннями, званими ротондами. Особливістю катакомб Сан Джованні є відсутність сімейних поховань у вигляді кубикул – їх місце займають великі аркосолії. Останні являють собою глибоку арку, під якою спочивають до 20 тел. Серед інших типів поховань можна відзначити локулы у формі чотирикутних заглиблень в стінах, поховання в підлозі, де поховані небагаті члени громади, і саркофаги.