Будівля синагоги в місті Томар вважається одним з найбільш добре збережених в Португалії подібних будівель, побудованих в епоху середньовіччя. Синагога знаходиться в історичному центрі міста. Варто відзначити той факт, що в синагозі знаходиться невеликий єврейський музей, який привертає величезну кількість туристів.

Синагога Томара була побудована в середині XV століття єврейською громадою міста. Якщо дивитися на будинок зі сторони, то синагога ніяк не виділяється серед інших будинків на вулиці. Сучасний головний вхід в синагогу був побудований пізніше і виходить на північну частину вулиці. У середньовіччі головний вхід був виконаний у вигляді стрілчастої готичної арки і виходив на східну частину вулиці, в напрямку Єрусалима.

Через вхід, відвідувачі потрапляють в квадратний хол. Три бічні нефи розділені чотирма колонами, які підтримують склепінчаста стеля в готичному стилі. Капітелі колон прикрашені геометричним і рослинним орнаментом. При розкопках за будівлею синагоги були виявлені залишки мікви, ритуального басейну, встановленого єврейським законом.

У 1496 році, коли були гоніння на євреїв, що проживають у Португалії, в синагозі знаходилася в'язниця. Пізніше там була церква, а після знаходився склад. У 30-ті роки ХХ століття старовинна будівля синагоги було викуплено польським вченим Самуелем Шварцем. Він відновив будівлю і пожертвував його португальському уряду з тією умовою, що в ньому відкриють музей. У 1939 році в синагозі відкрили єврейський музей Авраама Закут, який був відомим астрономом в середньовіччі. Серед експонатів музею – середньовічні могильні плити. Одним з найвідоміших експонатів вважається кам'яна плита, яка датується 1308 роком і привезена з синагоги Лісабона.