У 20 столітті не раз робилися спроби по створенню музею єврейської культури у місті Вільнюс, точніше, їх було три. Перший раз відбувся в 1913 році, але музей пропрацював до початку Другої світової війни. За час існування музею була зібрана колекція унікальних предметів народного мистецтва, документів і періодичних видань, книг. До початку Другої світової війни у своїй колекції музей налічував понад 6 тисяч книжок, тисячі документів, історичних та етнографічних праць. Було створено велику кількість періодичних видань на більш ніж 11 мовами світу, а також найбагатшу колекцію фольклору. Музей міг надати більше трьох тисяч художніх робіт. Але за час війни вона була майже повністю знищена.

У 1944 році був знову відтворений музей тими людьми, які вижили у війні. Другий музей мав за мету відродити єврейську культуру і зберегти в пам'яті людей тисячі загиблих від рук фашизму, а також розстріляних, спалених і закатованих у концтаборах. 10 червня 1949 році музей знову був закритий за наказом радянської влади, які приводили політику антисемітизму. Вся колекція музею була розподілена між архівами і Литовськими музеями.

В період того часу, коли Литва була радянською республікою, було неможливо створити будь-який інститут, який міг би займатися єврейською культурою та релігією. Минуло сорок років тому і вже 1 жовтня 1989 року розпочав свою роботу третій музей єврейської культури, який має місце бути досі. Керівником музею став керівник міністерства освіти і культури.

Відкритий вже в 1989 році Литовський Державний музей імені Віленського гаона мав колекцію, яка складалася з аксесуарів єврейської етнічної культури, фотографій, статей, друкованих і рукописних документів, книг і творів мистецтва. Не тільки основний, але і допоміжний фонди містять у собі по 5 тисяч експонатів кожен.

Багаті зібрання колекцій музею можна підрозділити на чотири розділи: колекція фотографій пам'ятників культури, прославлених політичних і культурних подій, пам'ятники видатних людей, а також монументи повсякденному житті; колекція культурних предметів, які використовувалися в різних релігійних обрядах, адже вони мали історичне значення, найстаріші експонати були представлені датами 18 століття; колекція рукописів та друкованих видань (щоденники, листи і документи); колекція графіки, скульптури, живопису та текстилю. Музей має роботи художників: Ефрона, Михтома, Лур'є, Мане-Катца, Биндлера, Перкова, Мергашильского та інших видатних людей.

Синагога є основним органом іудаїзму, культурним, політичним та економічним центром єврейської громади. На даний момент в Литві діють дві діючі синагоги – в Каунасі і Вільнюсі.

Ілля бен Соломон Залман – Віленський гаон (1720-1797) був самим освіченим дослідником Тори і Талмуда в 17 і 18 століттях. Його неабиякий інтелект і висока духовність дали йому велику перевагу в інтерпретації Талмуда і Тори. Цим дослідженням він присвятив все своє життя. Найбільша кількість його робіт було написано російською та литовською мовами. Саме цією людиною були розроблені нові методики вивчення Талмуда, а також критичні зауваження. Він зробив все можливе для повернення єврейського закону до раціональної первісній основі.

Ілля бен Соломон Залман знайшов застосування найважливішим методам Вавилонського Талмуда і в Єрусалимі. Він був першим єврейським вченим, який зрозумів, що старіння документів завжди призводить до помилок та невірного тлумачення написаного. Якщо мали місце випадки, коли текст викликала дуже багато сумнівів, то він з особливою ретельністю проводив його порівняння з оригіналом. Саме так він прояснив, що написано на складних і розпливчастих фрагментах. Крім того, Гаон серйозно вивчав географію та історію, область математики, анатомії та астрономії. Він написав близько 70 робіт на найрізноманітніші теми, опубліковані вже після його смерті.

На даний момент музей має в своєму розпорядженні кількома постійними експозиціями, які присвячені трагічній долі євреїв ще до початку Другої світової війни.