Францисканський монастир і церква свв. Филипа і Якова знаходяться на високому плато на березі Дунаю в старій частині Вуковара. Перший камінь у фундамент храму, присвяченого апостолам Филипа і Якова, був закладений в 1723 році. Будівництво церкви закінчилося через 10 років, в 1733 році, а будівлю монастиря було завершено в 1736 році. Пізніше церква перебудовувалася і відновлювалася.

У 1896-1897 роках проводився капітальний ремонт і розширення монастиря і церкви під керівництвом віденського архітектора Річарда Йордано. Після розширення церква набула довжину 58 метрів, що робить її третьою в Хорватії після дяковского і загребського соборів.

Монастир і церква є типовими будівлями в стилі «бароко Марії Терезії», поширеного в континентальній Хорватії.

Під час сербської агресії церква і монастир сильно постраждали, оскільки піддалися більш ніж 3000 ударів з повітря. Більша частина цінностей була врятована францисканцями за межами Хорватії.