Національний парк Матсалу, розташований в західній частині Естонії, займає площу в 486.4 кв. км. території заповідника відноситься нижню течію річки Казари, прибережна смуга затоки Матсалу Балтійського моря і близько 50 острови Моонзундського протоки. Затока Матсалу досить дрібний, його глибина складає всього півтора метра, довжина – 18 км, а ширина – 6 км. Заповідник діє з 1957 року. Метою його роботи є охорона природних комплексів, а також захист численних видів птахів, що мешкають на території Матсалуского заповідника.

До переважним ландшафтів заповідника належать лісові зарості і водні простори. Крім того, в Національному парку Матсалу можна зустріти заливні луки, зарості очерету, рогозу і очерету. Практичні будь-які вологолюбні рослини відмінно приживуться на території заповідника. В цілому, рельєф заповідника рівнинний, де-не-де зустрічаються пагорби.

Фауна Національного парку представлена, в основному, птахами. Серед ссавців, які отримали найбільше поширення в Матсалу, можна відзначити лосів, кабанів, лисиць, диких косуль, єнотовидних собак, крім того, зустрічаються їжак, бурозубки, кріт. Великою чисельністю виділяється мешканка водяних островів – водяний щур. На території заповідника зареєстровано 772 виду рослин, 49 видів риб.

В заповідники налічується близько 250 видів птахів, причому 160 з них є гнездящимися. Найбільш поширеними є водоплавні та болотні птахи. До постійним мешканцям можна віднести таких птахів, як крячки, гаги, крохалі, турпани, чайки, галагаза, чубаті чернетки. Серед перелітних птахів, основну масу складають північні качки, кулики і лебеді-кликуни. Крім перерахованих, до найбільш типовим мешканцям заповідника відносяться сірі гуси, казарки, крижні, червоноголові нирки. Серед великої різноманітності птахів особливо виділяються два види: велика бугай, т. к. стала емблемою заповідника, а також білощока казарка, тому що знаходиться під захистом Червоної книги Росії.

Колонії птахів тут настільки великі, що ніякі примхи природи їм не страшні. Так на острові Анемаа живуть чайки, яких настільки багато, що хижаки побояться сюди наблизитися, так як вся зграя нападе на можливого кривдника. Гаги облюбували для себе острів Папилад.

Таким чином, для орнітологів тут знайдеться чимало роботи. Окрім різноманітних досліджень та спостережень, фахівці займаються перевіркою пташиних гнізд, паралельно кольцуя пташенят чайок. Першовідкривачем кільцювання птахів прийнято вважати вчителя Мартенсона, який в кінці минулого століття надів на лапки птахам алюмінієве кільце з номерами для того, щоб прослідкувати їх шлях перельоту. Завдяки вдалому експерименту, кільцювання з тих пір отримало широке поширення.

Для того щоб спіймати птаха, орнітологи використовую особливі автоматичні лучки-пастки, які ставляться на гніздо. Коли птах сідає, пастка спрацьовує і сітка накриває її. Відлов птахів відбувається не тільки для кільцювання, але і для вивчення, а також виявлення хвороб.

За пернатими мешканцями Національного парку Матсалу можна спостерігати зі спеціальних обладнаних оглядових вишок. Крім того, для зручності відвідувачів, в самому центрі заповідника в Пенийые знаходиться музей та готель. Насолодитися красою заповідника можна пішки, або на велосипеді або навіть човні. Щоосені недалеко від міста Лихула проходить міжнародний фестиваль фільмів про природу Матсалу.