У далекому минулому В літній період 1931 року з Ленінграда в Мурманську область приїхав молодий геоботаник Аврорин Микола Олександрович, щоб продовжити дослідження започатковані професором Сергієм Сергійовичем Ганешиным, загиблим в Хібінах. Микола Олександрович збирався пробути тут, лише один літній сезон, але залишився в даних північних краях на 29 років.

В серпні цього ж року Аврорин представив групі вчених Кольського філії АН СРСР для обговорення тоненьку книжечку, з наявністю в ній 19 сторінок, на яких був представлений проект «Полярно-альпійський ботанічний сад в Хібінах». Даний проект підтримали видатні вчені та затвердили місцеві влади. У жовтні належне рішення ухвалила Президія АН СРСР, а Микола Олександрович був призначений директором Саду.
Майже до кінця 90-х років Полярно-альпійський ботанічний сад в Хібінах єдиний у світі перебував за Полярним колом.

Спочатку Полярно-альпійського ботанічному саду була відведена територія близько 500 га, на сьогоднішній день вона становить 1670 га, 80 з яких представляє паркова частина з оранжереями, розсадниками та іншими експозиціями. Спільно з Аврориным з 1932 року приступили до роботи молоді фахівці, у минулому студенти Ленінградського університету, успішно його закінчили.

Влітку 1932 року формуються унікальні колекції живих рослин ПАБСИ. Перші зразки були подаровані Ботанічним інститутом Академії Наук і включали в себе представників 26 різновидів чагарників і більше 50 різновидів трав. Спочатку зразки були висаджені на маленькі ділянки, які вдалося відвоювати у ліси. Наполегливою та тяжкою працею перших співробітників створюються розплідники, і прокладається мережа стежок.

У довоєнні роки Сад стає відомим і отримує визнання. Серед його відвідувачів багато академіків і відомих діячів науки. У важкі роки війни Сад продовжує роботу. Вся його діяльність у цей час спрямована на потреби фронту. У хімічній лабораторії Саду розробляються технології переробки тутешніх ягід на сиропи, соки, повидла без використання цукру. Розроблена методика отримання з лишайників глюкозной патоки. Незважаючи на тяготи воєнного часу, співробітниками Саду були повністю збережені колекції і гербарій.

У 1946 році уряд надав підтримку ПАБСИ фінансами та кадрами, у зв'язку з цим значимо розширилася тематика досліджень, зросла чисельність колективу, поповнилися ряди фахівців. Статус інституту, що входить до складу Кольського філії Академії Наук СРСР було присвоєно Саду в 1967 році.

У 1981 році до 50-річчя з дня його заснування, за всі заслуги Полярно-альпійський ботанічний сад-інститут був удостоєний ордена «Знак Пошани». До 70-річного ювілею йому присвоюється ім'я його засновника Н.А. Аврорін.

Щороку Сад відвідують тисячі екскурсантів. У цьому місці можна зробити знайомство з представниками флори різних країн, зі специфікою їх росту і розвитку в не зовсім звичайних умовах, де влітку ймовірні заморозки, а також снігопади. У спеціальних експозиціях і розплідниках представлені унікальні колекції рослин ("Кам'янистий сад", "Сад пролісків", "Живий гербарій"). Екскурсанти, що прибувають з найвіддаленіших регіонів Росії або навіть зарубіжних країн, зустрічаються тут з рослинами, які ростуть на їх батьківщині.

Також Ботанічний сад запрошує відвідувачів зробити екскурсії в оранжерею рослин, які ростуть у тропіках і субтропіках, в музей історії і формування ботанічного саду. Знайомить екскурсантів з рослинністю різних висотних поясів Хибинских гір екскурсія по екологічній стежці.