Командорські острови були відкриті в 1741 році під час експедиції, очолюваної командором Витусом Берінгом, і названі в його честь. Довгий час після відкриття острова були безлюдні, перші поселенці – алеути і креоли стали обживати острови лише в 1825 році, утворивши потім на островах своєрідну і неповторну за своїм етнічним традиціям креольську групу. Село Нікольське на найбільшому з Командорських островів - острові Берінга – єдине поселення алеутів в Росії.

У часи Царської Росії Командорські острови були одними з основних постачальників хутра, поповнюючи царську скарбницю. Безконтрольне винищення тварин, «хутрова лихоманка», що призвели до масового винищення котиків, катастрофічно скорочуючи їх чисельність. Тільки в кінці XIX століття почала здійснюватися охорона лежбищ, і були введені обмеження видобутку каланов і морських котиків. Контроль над промислом каланов і заборону видобутку морських котиків були введені в 1911 році.

У Радянський час ситуація на Командорських островах покращилася – з 1958 року було введено заборону на лов риби в тридцатимильной зоні навколо островів, у 1980 році на території островів був створений Заказник, який з 1983 року придбав обласне значення. Федеральне значення і назва «Державний природний заповідник федерального значення «Командорський» отримує 23 квітня 1993 року, а в кінці 2002 року йому присвоюється статус «біосферного» під егідою ЮНЕСКО.

Командорський заповідник – другий за величиною території серед заповідників Росії. Його площа становить 3 648 679 гектарів, включаючи 185 379 гектарів суші і 3 463 300 акваторії Тихого океану і Берингової моря. На території немає вулканічної активності, але бувають землетруси.Заповідник розташований в південній частині острова Беринга, на островах Топорков, Арій Камінь, Мідний, розташовані компактною групою на схід від Камчатського півострова.

Заповідник поділено на території з різним ступенем охорони:
- заповідні ядра – на цих ділянках заборонено втручання людини у природні процеси, абсолютний заповідний край;
- буферні зони – дозволений традиційний промисел та обмежена господарська діяльність.

На території Командор знаходиться безліч озер, річок, боліт, водоспадів. Практично всі річки – місця нересту лососів. Озеро Саранне – найбільше на Командорах нерестовище нерки. Клімат на островах субарктичний – вологий і вітряний.

Тваринний світ Командорського заповідника дивовижний і різноманітний.Під охороною заповідника – ластоногі тварини, кити, блакитні песці, червоні полівки, американські норки, дикі північні олені, більше мільйона птахів. У прибережних водах островів зустрічається 17 видів китів: кашалоти, малі полосатики, командорські ремнезубы, кити-клюворылы, японські і горбаті кити, финвалы і сейвалы. У пошуках їжі кити підпливають близько до берега, дозволяючи туристам милуватися випускаються фонтанами води і величними силуетами.

Ластоногі тварини – головне багатство заповідника. На островах мешкає понад 250 000 каланов, сивучів, антуров, ларгов, морських котиків, морських зайців, крилаток, моржів та інших видів. Синій і гренландський кит, малі полосатики, антуры, командорські ремнезубы, калани занесені в Червону Книгу.

Завдяки своєрідності рослинного світу островів, Командори виділені в окрему від флори Камчатки і Алеутських островів флористичну область. Із-за частих і сильних вітрів на островах немає дерев, і тільки в захищених від вітрів долинах і розпадках ростуть невисокі і сильно вигнуті чагарники з верби і горобини, а на відкритих ділянках зустрічаються зарості ялівцю.

Долини річок і береги озер багаті кольорами, багато видів яких занесені в Червону Книгу: черевичок великоквіткова, черевичок Ятабе, черевичок справжній, полушник морський, трілліум камчатський і арніка Лессінга. Без особливого дозволу в заповіднику можна збирати ягоди і гриби.

Командорські острови приваблюють туристів з усього світу своєю дикою, первісної, незайманою природою. Період з липня по вересень – найсприятливіший для відвідування заповідника. Для туристів розроблено два діючих маршруту: «Алеутська стежка на острові Мідний» та «Знайомство з фауною і флорою острова Берінг». Програма круїзів включає в себе відвідування села Нікольського, лежбища морських котиків, огляд островів Топорков, Мідний, Арій Камінь.

Дістатися до адміністративного центру Командорських островів – села Нікольського на острові Беринга, можна трьома способами: літаком Л-410 із аеропорту Єлізово, вертольотом МІ-8 або морським пасажирським судном. Подорожі по заповіднику проводяться на ГАЗ-66, УАЗ, ЗІЛ-131, Уралі або пішки, по воді – на моторних човнах «Zodiac».