Церква Милосердя у Авейру знаходиться в тому ж сквері, що і міська ратуша. Спочатку за проект церкви відповідав італійський архітектор Філіппо Терціо. Будівництво під його керівництвом було розпочато в 1585 році. Варто відзначити, що цей архітектор так само будував і багато інші будівлі в Португалії, серед яких були не тільки церкви, але й форти. Церква будувалася дуже довго. Закінчував будівництво в 1653 році вже інший архітектор, португалець Мануель Азенья.

Храм прославився своїм грандіозним порталом та фасадом, прикрашеним кахлями-азулезуш XIX століття. Фасад храму прикрашає справляє досить сильне враження класичний портал, виконаний з вапняку. Пізніше у прикраса порталу були додані елементи в стилі бароко. Вхід у церкву прикрашають чотири колони коринфського ордера. У нижній частині між колонами зроблені ніші, в яких знаходяться кам'яні статуї. У верхній частині, так само між колонами в нішах раніше були статуї, а потім замість них зробили вікна. Крім того, фасад будівлі прикрашає кам'яна статуя Богоматері Милосердя. У самій верхній частині фасаду знаходиться королівський щит і армиллярная сфера (стародавній астрономічний прилад).

Всередині церква має довгий високий неф і дуже розкішна оформлена. Стіни покриті кахлями-азулезуш з візерунчастим орнаментом XVI століття. У вівтарній частині храму привертає увагу склепінчаста стеля. Варто відзначити, що стеля зроблена з каменю, привезеного з провінції Ансан, і використовується при будівництві пам'ятників в цій частині Португалії.