Здавна на цьому місці було святилище Аполлона. Пізніше був побудований іонічний храм Аполлона. Це було грандіозне спорудження, у свій час не поступалася по розкоші храму Артеміди в Ефесі, і настільки ж знаменита, як святилище Аполлона в Дельфах. У Дідімі жили тільки жерці цього храму. Раз на чотири роки вони проводили свята на честь цього бога зі спортивними змаганнями та музичними виставами.

У V столітті до н. е. храм зруйнували перси, але при Олександрі Македонському його вирішено було його відновити і розширити. Але добудувати храм так і не вдалося, а пізніше візантійці розтягнули майже весь мармур. Залишилися тільки три великі колони і маса дрібних каменів.

Всесвітньо відомий виразний рельєф на камені, що зображає голову Медузи-Горгони.