В центрі міста Іракліон, неподалік від Археологічного музею знаходиться Музей оборони Криту. Музей був заснований муніципалітетом Іракліона в 1994 році і присвячений обороні Криту і народного опору в період Другої світової війни. Метою музею є збір, охорона і демонстрація історичних реліквій 1941-1945 належним чином, а також документування та розповсюдження інформації про народної боротьби під час битви за Кріт і німецько-італійської окупації.

У музейній експозиції представлено тисячі оригінальних фотографій, картин і малюнків битви за Кріт і народного опору, близько 200 книг, монографій, нарисів історичних подій з 1941 по 1945 рік, сотні документів і газетних публікацій. У музеї також представлені різні предмети, пов'язані з війною: зброя, форма, різні аксесуари, предмети побуту та багато іншого.

Основна частина виставкових експонатів висвітлює «Битву за Кріт» у травні 1941 року. Ця битва є однією з найбільших в історії Другої світової війни повітряно-десантної операцією і відома також як «Операція Меркурій». Головною метою німецьких загарбників було витіснення Великобританії з Середземного моря і встановлення стратегічного контролю над Середземноморським басейном. Організатором народного ополчення був британський археолог, який працював на британську розвідку, Джон Пендлбері. Незважаючи на численні втрати, німці виграли битву.

У музеї є свій науково-дослідний центр, співробітники якого зосереджені на зборі архівних матеріалів військового часу різних країн (1940-1945) та їх переклад. Діяльність музею спрямована на привернення уваги молодого покоління до історії критського народу і усвідомлення руйнівної сили війни.