Церква Святого Франциска, розташована в місті Кочі, в штаті Керала, є історичним пам'ятником часів колоніального періоду в Індії. Її історія почалася після того, як Васко да Гама висадився на індійському березі в 1498 році. Португальці незабаром побудували в Кочі (в той час Кочин) укріплений форт, на території якого була зведена також і дерев'яна церква на честь святого Бартоломью. Але через нетривалий час за наказом віце-короля Португалії всі дерев'яні будівлі були замінені кам'яними і цегляними. На місці старої церкви монахами-францисканцями була побудована нова з цегли. Вона була завершена в 1516 році і стала носити ім'я Св. Антонія. Але в 1663 році влада в місті Кочі перейшла в руки голландців. А так як вони були протестантами, на відміну від португальців-католиків, то всі церкви міста були зруйновані. Уціліла тільки ця церква Св. Антонія, але вона була «перероблена» в протестантську. Коли Кочі завоювали в 1795 році британці, церква була знову перейменована і стала церквою Св. Франциска, зберігши це назва і донині. У 1923 році вона потрапила в список історичних пам'яток, що охороняються Суспільством археологічних дослідженням Індії.

Головною визначною пам'яткою цієї церкви є те, що саме в ній був похований Васко да Гама, який помер у Кочі в 1524 році, під час свого третього візиту в Індію. Але через чотирнадцять років його останки були перевезені в Лісабон.