Церква великомучениці Варвари знаходиться на березі мальовничого озера Яндомозеро і витягнута зі сходу на захід. Розташовується церква в самому центрі села і несе в собі функції архітектурної домінанти всього поселення. Зведення церкви довелося на період з 1653 по 1656 року.

Знаменита церква належить до церков типу «восьмерик на четверику». Такого роду будівель поблизу Онезького озера чимала кількість, але тільки Варваринська церква є однією з найбільш ранніх споруд даного типу. Освітлення церкви відбулося в 1650 році. Спочатку церква була клетській і складалася з декількох приміщень – молитовного приміщення, вівтаря і трапезної.

На початку 18 століття значно збільшилася кількість сіл, які були приписані до парафії, що і послужило важливим приводом для реставрації в 1865 році. Під час проведення ремонтних робіт був перебраний зруб, розтесано вікна в трапезній і заново прорізані вікна в церковному приміщенні. Наступні реставраційні роботи відбулися у 80-х роках 20 століття, коли трапезна церкви набула вигляду 17 століття. При цьому заново були пробиті два волокового вікна і залишено одне косящатое, замінений охлупень, який прикриває стики притвору і трапезної, і замінений тес покрівлі.

Строгий шолом, розташований на даху не є недбалістю реставраторів, просто в Карелії найчастіше йому надавали форму голови птиці або коня і більш ретельно отесывали, не прикрашаючи. Що стосується конструктивних елементів, що стосуються покрівлі, у Карелії було прийнято прикрашати декоративною різьбою тільки кінці «стелі». Різьблення здійснювали за допомогою долота, сокири, рідше застосовувався коловорот, що безпосередньо залежало від стилю планованої різьби. Різьба застосовувалася декількох видів: площинна, яка була розрахована на найближчий розгляд; об'ємна, яка була добре видна з дальньої відстані і велика незграбна, якій були прикрашені «стелі», розташовані на переломі покрівель рундуків ганку храму.

Як відомо, ганок церков завжди прикрашається набагато ретельніше. Об'ємна різьба застосовувалася при прикрасі стовпів, що підтримують покрівлю, глуха різьба прикрашала прічеліни, прорізній різьбленням прикрашалися облямівки, пущені між стовпами під покрівлею.

Особливу увагу в Варваринської церкви можна звернути на дзвіницю, яка була побудована в 18 столітті. На підставі розташований четверик невеликого розміру в кілька вінців, що представляє собою восьмигранний зруб. Майданчик для дзвону відкрита і прикрита високим шатром, над яким і підвішували дзвони. Перехід, що з'єднує церкву і дзвіницю веде до внутрішньої сходах прямо на майданчик для дзвону. З цього місця можна розглянути всі заонежские дали і докладно вивчити конструкцію дзвіниці, яка зберігає в собі свою власну історію.

В основі дзвіниці могло бути до дев'яти стовпів, адже чим їх більше, тим більш стійка дзвіниця, особливо при подгнивании. Пізніше стовпи стали обноситься зрубами. Для найменшого подгнивания стовпів, їх стали ставити не на землі, а в зрубі або на ньому. Стовпи мали опору на балки і були затиснуті зрубом, що не сприяло гниття. Якщо відбувалося підгнивання зрубу, то можна було просто замінити вінець, розташований внизу, що значно спрощувало процес ремонту. Даного роду конструкцію можна побачити на Яндомозерской дзвіниці. Той четверик, який розташований в підставі, з'явився в 17 столітті і мав кілька вінців. Пізніше їх кількість почала збільшуватися, дійшовши до половини зрубу дзвіниці.

Що стосується молитовного приміщення, то воно виконано у формі шестнадцатичастного «неба». Трехкосящатые і волоковое вікно збереглися до наших днів. Архітектурна частина представлена облямівками і різьбленими стовпами ганку і дзвіниці, порізкою у вигляді піки усіх кінців тесу в сінях і на ганку-галереї. Саме ці частини церкви Варвари Великомучениці несуть у собі історико-архітектурну цінність як приклад становлення і розвитку всіх шатрових храмів, розташованих на Російській Півночі.