Історичний музей, розташований у Санданскі, є однією з головних визначних пам'яток міста. Музейна справа в Санданскі почалося зі створення в 1936 році археологічної спільноти «Струма». Колекція, зібрана учасниками цієї групи, що перебувала в той час у Першій початковій школі міста.

В 1960 році почалося систематичне проведення розкопок, метою яких було виявлення древніх будівель (житлових будинків, храмів і т. д.) і артефактів на території античного міста, розташованого під сучасним Санданскі. Розвиток археології благотворно позначилося на розвитку музею: були знайдені нові експонати, дополнившие колекцію, розроблялися способи відновлення та збереження культурної спадщини.

Музейний комплекс, відкритий у 1960 році, розташований на місці, де колись стояв древній місто. Відвідувачі можуть побачити тут руїни різних споруд: ранньохристиянська базиліка єпископа Іоанна і некрополь, гімнасій (установа, в якому займалися фізичною підготовкою), терми і житлові будівлі. Одним з найцікавіших об'єктів, виявлених за останні роки, є єпископський комплекс, що включає базиліку, баптистерій, атріум з колонадою, приміщення і споруди, які в даний час ще вивчаються.

Крім цього в колекції комплексу – надгробні плити, монети, керамічні вироби, предмети побуту, прикраси, що відносяться до різних історичних періодів.

Музей має у своєму розпорядженні багатим архівом і зручним приміщенням, де зберігаються виявлені знахідки, документи, знімки та інші матеріали, що стосуються проведення археологічних робіт.