В 1862 році, після невдалого п'ятирічного роману з російською дівчиною Ольгою Смирнитський, який зав'язався під час літніх концертів Штрауса в Санкт-Петербурзі, він, нарешті, одружився на співачці Йетти Халупецкой (сценічне ім'я Трефц). Рік потому вони переїхали в квартиру на Пратерштрассе 54, в якій прожили 7 років. Дружина була на сім років старше Йоганна Штрауса. У неї до того часу вже було семеро дітей. Незважаючи на це, їх шлюб був цілком щасливим.

На початок 1870-х років припав розквіт творчості Штрауса. В цей час він написав знамениті вальси «Казки Віденського лісу» і «На прекрасному блакитному Дунаї». У цей період Штраус передав придворні обов'язки своєму братові і зайнявся оперетою, написавши всього 15 творів.

Під час гастролей по Великобританії і США, Штраус поставив світовий рекорд під час керування оркестром чисельністю більше тисячі чоловік.

Після смерті першої дружини, Штраус був одружений двічі: 4 роки він був одружений на співачці Ангеліні Дітріх, а в 1882 році його дружиною стала Аделі Дойч. Незважаючи на три шлюбу, своїх дітей у композитора не було. Останні роки свого життя Йоганн Штраус майже не виходив з дому, зробивши виняток лише в честь 25-річчя оперети «Летюча миша». Під час цієї хвилюючої подорожі він сильно застудився. Помер Штраус від запалення легенів у віці 73 років.

Аделі, вдова композитора, присвятила себе створенню музею Йоганна Штрауса, збираючи всі цікаві листи та ноти. У музеї, який розташований в колишній квартирі на Пратерштрассе, зібрані музичні інструменти композитора, картини та меблі, партитури вальсів, а також особисті речі Штрауса. Крім того, тут експонуються речі батька Штрауса і його братів. Інтер'єри музею відтворюють атмосферу того часу, де колись жив і творив Йоганн Штраус, який подарував світу 496 великих творів.