Музей І. Д. Папаніна створений в 1989 р. в будинку, в якому він, приїжджаючи в Борок, жив і працював. Музей розташований на території колишнього маєтку Н.А. Морозова, знаменитого революціонера, де сьогодні розташувався Інститут Біології Внутрішніх вод ім. І. Д. Папаніна. Цей інститут є одним з провідних підрозділів Російської Академії наук, яка займається актуальними екологічними проблемами, пов'язаними з внутрішніми водоймами.

Інститут тут створений не випадково. Адже Н.А. Морозов не тільки був революційним діячем, але і знаменитим ученим. Микола Олександрович, оселившись в Борке, продовжував вести наукову діяльність і широко спілкувався з видатними вченими свого часу. В 1932 р. він відкрив тут "Будинок праці і відпочинку" для вчених. Це і стало відправною точкою для організації тут у 1938 р. "Верхньо-Волзької бази" для вивчення вивчення динаміки тваринного світу і рослинності, грунтових процесів.

Борок передали Інституту еволюційної морфології і перетворили в "Біологічний стаціонар" з власним штатом. У 1946р. після смерті Морозова маєток перейшов Стаціонару, а сам він був реорганізований у Науково-Дослідницьку станцію "Борок" їм. Н.А. Морозова. В грудні 1951 р. в Борок була відправлена авторитетна комісія під головуванням В. Д. Папаніна, доктора географічних наук, з метою визначення подальшої доля Станції. В 1952 р. було прийнято рішення реорганізувати Науково-Дослідну Біологічну станцію "Борок" в наукову базу для проведення робіт, спрямованих на вивчення штучних водосховищ. Станція була оснащена всім необхідним сучасним обладнанням, забезпечена потрібними лабораторіями, флотом для проведення наукової діяльності. Папаніна І. Д. тимчасово призначили директором НИБС.

Почалося бурхливий розвиток і процвітання Борка. Автором і реалізатором цього зростання був В. Д. Папанін, знаменитий на весь світ полярник, контр-адмірал, доктор географічних наук, кавалер дев'яти Орденів Леніна і володар інших нагород, начальник Відділу морських експедиційних робіт Академії наук СРСР. Він був людиною-легендою, мав міцною рукою, тверезим розумом, дисциплінованістю і добротою. Життя його сповнене було пригодами, подвигами і творчою працею.

Будинок, в якому розташовується музей, був одним з перших тут будинків "фінської" споруди 1950-х рр. Він стоїть невеликий березової гайку окремо, поряд з лабораторними корпусами Інституту Біології Внутрішніх вод. Цей дерев'яний щитовий будинок зберіг свій внутрішній вигляд саме в тому вигляді, який і був при Папанине. Всі речі тут підкреслюють невибагливість і скромність господаря будинку. В музеї знаходиться 5 меморіальних кімнат: їдальня, передпокій, кухня, кабінет-спальня, ванна. Тут два експозиційних приміщення: засклена веранда і колишня комора, тамбур з ганком та службова кімнатка.

На веранді представлений доборковский період життя Папаніна у вигляді фотографій і фотодокументів. Тут можна побачити знімки часів Громадянської, а потім Вітчизняної війни, полярних експедицій, періоду роботи в Географічному товаристві.

У музеї представлені унти, в яких І. Д. Папанін ходив по Північному полюсу, його радіо і патефон, який подарували йому захоплені американці з нагоди його повернення з крижини. Відвідувачі можуть побачити контр-адміральський кітель полярника, його формений кашкет і чохли від його мисливських рушниць.

У їдальні, в якій господар приймав гостей – буфет, диван з бязевым чохлом, розсувний обідній стіл, накритий білою скатертиною, стільці, два крісла, нехитрі картини на стінах. Тут влаштовувалися ділові зустрічі, велись бесіди з працівниками, часом досить гострі.

У кабінеті, який служив також спальнею, можна побачити письмовий двотумбовий стіл, металеву ліжко, накриту пікейним ковдрою, телевізор, радіоприймач, стільці, м'яке крісло. На стінах – дві картини, датовані 1938 р., які написані маслом і присвячені герою Арктики. На його робочому столі - чорнильний дерев'яний прилад, який Папаніна подарували вихованці дитячої комуни в 1934 р.

На кухні – кустарного виробництва кухонні меблі, газова плита, котел парового опалення.

У центральній експозиційної кімнаті розповідається про історію розвитку Інституту біології у документах і фотоматеріалах. У передпокої стоїть проста тумбочка і вішалка для одягу.

Музей відвідують приїжджають в Борок на семінари, конференції, наради, симпозіуми та консультації гості. Також музей цікавий іноземним туристам. Часто музей відвідують екскурсійні групи з учнів, які приїжджають сюди з різних міст області.