Барнаульський Знаменський жіночий монастир – одна з найвизначніших пам'яток Алтайського краю. У червні 1754 р. в Барнаулі відбулося освячення новозведеної церкви на честь святих і праведних Захарія і Єлисавети. Вже до 1772 р. церковна будівля сильно постаріла. Тоді було прийнято рішення побудувати новий храм. Нову дерев'яну церкву звели у 1778 р. на кошти, пожертвувані місцевими жителями. Автором даного проекту виступив учень В. Ползунова В. Черніцин.

У 1844 р. відомий архітектор Турський розробив проект нової мурованої трьохпрестольної церкви, який представив на розгляд Томської губернської будівельної комісії. Однак цей проект не був втілений в життя, і тільки в серпні 1852 р. була отримана грамота на спорудження нового мурованого храму. Закладка храму відбулася в 1853 р. Остаточний проект кам'яної церкви затвердили в 1856 р, а через два роки на пожертви віруючих, на Сінній площі був зведений дивовижний храм з триярусною дзвіницею і дванадцятьма дзвонами. У 1916 р. при Знам'янської церкви звели муровану каплицю на честь 300-річчя царювання будинку Романових.

Після жовтня 1917 р. храм спіткала така ж доля, що і більшість інших церков на Русі – його закрили. У жовтні 1918 р. парафіяни вирішили щорічно вносити деяку суму грошей для підтримки храму, однак нова влада не підтримала дану ініціативу, і в 1922 р. під приводом допомоги голодуючим Поволжя почалася кампанія по вилученню храмових цінностей.

У квітні 1939 р. за рішенням Крайвиконкому церква остаточно закрили. У тому ж році був знесений купол, розбита дзвіниця. Трохи пізніше біля будівлі надбудували другий поверх і зробили інші прибудови. Церква втратила історичний вигляд.

Наприкінці 1992 р. її повернули Православній Церкві. Від красивого храму залишилися лише стіни, понівечені прибудовами. Незабаром почалися роботи з відновлення зруйнованого храму. У 1994 р. при Знам'янської церкви був заснований жіночий монастир. На сьогоднішній день у монастирі 20 насельниць.