Національний музей Республіки Адигея був заснований в 1925 р. як адыгский історико-етнографічний музей. Ініціатором його створення виступило Товариство вивчення Адигської області. Першим директором і єдиним працівником національного музею до 1935 р. був В. О. Наврузов, який зібрав багатий етнографічний та історичний матеріал для музейної колекції.

Досить тривалий час Адигейський музей не мав свого постійного притулку. З 1929 р. він розташовувався в Краснодарі. Після того, як Майкоп в 1936 р. став столицею Адигейської автономної області, музей перейменували в Адигейський обласний краєзнавчий і перенесли в Майкоп. В травні 1950 р. для музею було надано нове приміщення на вулиці Першотравневій. Своїх перших відвідувачів на новому місці він прийняв у 1954 р. В березні 1993 р. музей було перетворено в Національний музей Республіки Адигея.

У 2001 р. в музеї відбулося відкриття двох залів постійно діючої етнографічної експозицією під назвою: «Культура і побут адигів в кінці XVIII - початку XIX ст.». У травні 2005 р. до 60-ї річниці з Дня Перемоги, була змонтована ще одна стаціонарна експозиція, що отримала назву: «Адигея під час Великої Вітчизняної війни 1941-1945 років». Через рік в музеї була відкрита експозиція, що представляє експонати бронзової доби, знайдені на території автономної республіки.

На сьогоднішній день в музеї відкрито 8 відділів, є власна бібліотека і архів. У його фондах зберігається близько 270 тис. експонатів. Сюди входять унікальні колекції монет, дорогоцінного каміння, одягу, фарфору, музичних інструментів і багато іншого. Також відвідувачі музею мають можливість ознайомитися з палеолітичної колекцією П. У. Аутлева і унікальними археологічними експонатами.