Церква Сан-Педро-де-Атакама знаходиться на однойменній площі однойменного міста. Вона є важливою архітектурною пам'яткою міста і однією з найстаріших церков країни.

Є документи, які свідчать, що в 1557 році на цьому місці була каплиця, в якій служив священик Дон Кристобаль Діас де-лос-Сантос. Теперішня церква збудована на місці каплиці, що датується 1745 роком. Маючи 41 м в довжину і 7, 5 м в ширину, церква Сан-Педро-де-Атакама нагадує величезний корабель, дивним чином опинився в пустелі Атакама. У церкві - просторий неф, трансепт і стрункі склепінчасті арки. Вівтар церкви, ймовірно, єдиний у своєму роді в Чилі, виконаний у стилі бароко і розділений колонами на три частини з нішами.

З заходу церкви знаходилася дзвіниця з чотирма дзвонами, побудована в 1782 році. Але в 1860 році башта була зруйнована. В кінці XIX століття на цьому місці була зведена дерев'яна дзвіниця, яку замінили на кам'яну в 1964 році, під час чергової реконструкції церкви.

Основний матеріал, який був використаний при будівництві церкви, - камінь вапняк. Вівтар і арки висічені з каменю. Дах покрита соломою, а стіни обмазані вапняним розчином.

Церква Сан-Педро-Атакама була оголошена національним пам'ятником Чилі в 1951 році.