Місто Коїмбра, розташований на пагорбі, є третім за важливістю містом Португалії. Його ще називають старовинним університетським містом, так як в ньому знаходиться один з найстаріших університетів Європи. Університет був заснований в XIII столітті і спочатку знаходився в Лісабоні. Але із-за поганої організації функціонування в 1537 році університет був перенесений в Коимбру.

Бібліотека Жуаніна знаходиться в Коимбрском університеті, поряд з університетської вежею і названа на честь португальського короля Жуана V, у часи правління якого і було побудовано будівлю бібліотеки. Будівля була побудована в XVIII столітті. Над входом в бібліотеку висить національний герб. Бібліотека розташована у верхній частині університету, і складається з трьох залів: червоного, синього і оливкової, які розділені декоративними арками. У кожному залі стоять двоповерхові книжкові полиці практично під саму стелю. Стіни бібліотеки дуже товсті, а двері зроблені з деревини тикового дерева, що сприяє збереженню певної температури всередині для того, щоб не заводилися комахи в дубових книжкових полицях.

В елементах декоративного оформлення інтер'єру бібліотеки яскраво виражений стиль бароко, відмінною рисою якого є достаток позолочених деталей. Столи зроблені з рожевого і ебенового дерева, а шкіряні палітурки книг, як і шкіряна оббивка крісел і шкіряні шпалери збереглися з часу заснування бібліотеки. Меблі в залах зроблена з екзотичних порід дерева, покритих позолотою.

У бібліотека зберігається велика колекція книг, яка активно використовується як студентами, так і викладачами університету. Серед цієї колекції є і рідкісні екземпляри, такі як одна з 20 давньоєврейських Біблій, яка вціліла у часи інквізиції.

У 1901 бібліотека була перейменована в Центральну бібліотеку університету, так як на факультетах були створені свої бібліотеки. У 1962 році було побудовано ще одну будівлю бібліотеки, оснащеннок сучасними технологіями, де зберігається ще більше мільйона примірників книг.